Esta coleção começou no século XVI pelo duque Albrecht V da Baviera, um filantropo e homem que fez muito pelo desenvolvimento cultural de Munique. Esta coleção foi localizada na residência do príncipe herdeiro Ludwig I e exibida no Salão Egípcio do Antiquário - Glyptotek. O Glyptotek foi posteriormente adquirido pela Academia de Ciências da Baviera e o museu, com o apoio do governo da Baviera, foi fundado em 1970.
Em junho de 2013, as exposições do museu receberam um novo prédio em frente à antiga galeria de arte da Gabelsberger Strasse, triplicando o espaço de exibição anterior. Agora eles estão localizados abaixo do nível do solo, sob o prédio do Instituto de Cinema e Televisão, projetado por Peter Böhm, e compreendem 1800 m2 de exposições permanentes e 400 m2 destinados a exposições temporárias.
Este museu é conhecido por ser o único no mundo especializado em arte egípcia. Sua coleção agora contém cerca de 8 mil amostras diferentes de arte antiga, das quais cerca de 2 mil são exibidas. A coleção inteira cobre o período de cerca de 5 mil anos da história do Egito, bem como parcialmente Núbia, Assíria e Babilônia.
As mais famosas exposições do museu são: A cabeça da esfinge de Senusert III, um retrato jovem na pedra de Amenemkhet III, a cabeça da estátua do faraó Tutmés IV, um cálice de vidro de Tutmés III - o mais antigo vaso de vidro artificial de 1450 aC. e Também é apresentado o culto póstumo do Egito antigo - o sarcófago do príncipe Ankh-Or, as máscaras póstumas de alguns nobres egípcios. Uma posição separada com um sistema de alarme sem precedentes demonstra os inestimáveis tesouros dourados da princesa Amani em seu túmulo.
Museu de Arte Egípcia engajado em atividades educacionais. Oferece programas de treinamento e excursões temáticas, tanto para estudantes quanto para profissionais, para professores e interessados em arte antiga.
